Het doel van De Jonge Akademie on wheels was om te laten zien dat wetenschap draait om nieuwsgierigheid naar de wereld om je heen. Docenten konden een bezoek van De Jonge Akademie on wheels winnen door met hun klas(sen) mee te doen met een prijsvraag. Van januari tot en met april 2012 werden maandelijks twee winnende scholen uitgeroepen. De leerlingen namen het tegen elkaar op in workshops, een estafette, experimenten en wierpen een blik in de wereld van wetenschap. 

In 2011 en 2012 is de gele schoolbus met in totaal ruim 200 wetenschappers naar 16 scholen in heel Nederland gereden en hebben ruim 1600 leerlingen uit onderbouw van vmbo tot gymnasium kennisgemaakt met wetenschap en jonge wetenschappers uit allerlei disciplines. 

De Jonge Akademie on wheels is in deze uitgebreide versie mogelijk gemaakt door SNS REAAL Fonds. Voor de uitvoering van het project is samengewerkt met het bureau De Praktijk.